人工耳蜗植入存在一定的风险，但并发症的发生率较低与普通的中耳手术差不多，并且大部分是轻度并发症。

2003年中华医学会耳鼻咽喉科分会公布我国的《人工耳蜗植入工作指南》，其中包括施行人工耳蜗植入术的可能风险。

（1）术中风险：可能发生麻醉意外；可能发生心、脑血管意外；可能发生术中出血量大需输血；可能发生面神经损伤致暂时或永久性面瘫；可能发生鼓索神经损伤致术后味觉改变；可能发生鼓膜、外耳道穿孔；可能发生乙状窦、硬脑膜受损；可能发生外淋巴漏、脑脊液漏；可能发生要移动或去除听骨、鼓索神经等中耳组织结构；可能发生电极植入受阻致有效电极不能完全植入或部分电极受损；可能发生因内耳畸形或骨化严重，无法植入电极；可能发生各种意外因素致使中止手术或采取抢救措施。

（2）术后风险可能发生皮瓣出血、皮下血肿；可能发生局部(切口、中耳、内耳)感染，皮瓣坏死，颅内感染；可能发生术后切口瘢痕，装置在耳后皮下隆起；可能发生电极移位或脱出；可能发生皮瓣增厚影响装置使用，需再次手术削薄；可能发生残余听力减退或丧失；可能发生耳鸣，眩晕；可能发生电极刺激时出现面肌抽搐和其他非听觉刺激；可能发生配戴体外装置导致皮肤过敏或对植入体内的部件过敏。

（3）其他风险：可能发生术前期望值与术后效果不一致；可能发生装置故障需手术取出或更换；可能发生难以适应新声音，甚至要求取出；不能接受产生诱导电流的医学治疗。包括:电外科手术、透热疗法、神经刺激疗法、电痉挛疗法、离子放射治疗。做磁共振时需再次手术，暂时取出植入体内磁铁；因其他疾病状况所增加的各种风险；目前未知的意外和风险。

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